Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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