Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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