Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms