Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll12Q3UDE2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms