Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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