Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pfdn6Q03958 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pfdn6Q03958 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pfdn6Q03958 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pfdn6Q03958 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pfdn6Q03958 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pfdn6Q03958 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn6Q03958 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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