Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms