Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms