Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms