Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn18P56857 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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