Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms