Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1rP09581 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms