Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms