Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm12320-201ENSMUST00000127333 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm21160-201ENSMUST00000185838 696 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Olfr573-ps1-202ENSMUST00000210571 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Lage3-203ENSMUST00000114153 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms