Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm21719J3KMI9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21719J3KMI9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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