Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Grik3B1AS29 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms