Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms