Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn3Q9DAW9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn3Q9DAW9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms