Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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