Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atxn3Q9CVD2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms