Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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