Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms