Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms