Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
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