Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms