Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms