Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Plac8l1Q08EJ0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Plac8l1Q08EJ0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms