Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms