Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms