Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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