Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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