Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gli1P47806 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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