Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sept1P42209 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sept1P42209 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms