Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CftrP26361 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CftrP26361 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CftrP26361 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CftrP26361 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CftrP26361 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CftrP26361 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CftrP26361 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CftrP26361 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CftrP26361 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CftrP26361 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms