Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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