Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Becn2P0DM65 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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