Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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