Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ccl20O89093 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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