Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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