Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BC117090L7N257 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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BC117090L7N257 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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