Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms