Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms