Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palm3A2TJV2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms