Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myom3A2ABU4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms