Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms