Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KnstrnQ9D9Z1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KnstrnQ9D9Z1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms