Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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