Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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