Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NsmfQ99NF2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms