Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrrtQ99MR6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrrtQ99MR6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrrtQ99MR6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SrrtQ99MR6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SrrtQ99MR6 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SrrtQ99MR6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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SrrtQ99MR6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrrtQ99MR6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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